分子是指保持物质化学性质的最小粒子。原子是指化学变化中的最小粒子。元素是指具有相同的核电荷数（即核内质子数）的一类原子的总称。
由分子构成的物质，分子是保持物质化学性质的最小粒子。原子是化学变化中的最小粒子。分子与原子都是构成物质的一种粒子，质量和体积都非常小，彼此间有间隔，在不停地运动，都既有种类之分，又有个数之别，都不显电性。分子总是在不断的运动，分子之间有间隙。
结构
分子结构，也称分子立体结构、分子几何，是建立在光谱学数据之上的数据之上的，用以描述分子中原子的三维排列方式。分子结构在很大程度上影响了化学物质的反应性、极性、相态形状、颜色、磁性和生物活性。
分子结构的最佳测定温度是接近绝对零度，因为随着温度升高，分子转动也增加。量子力学和半实验分子模拟计算可以得出分子形状，固态分子的结构也可通过X射线晶体学测定。体积较大的分子通常以多个稳定的构象存在，势能面中这些构象之间的能垒较高。
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