通过肛门指诊和肛周彩超检查确诊肛瘘后，需要尽快进行手术治疗。肛瘘一般分为低位肛瘘以及高位复杂性肛瘘，无论是哪种形式的肛瘘，都需要尽早进行手术切除。 低位肛瘘一般选择单纯低位肛瘘切除手术，而高位复杂性肛瘘在手术之前一定要完善肛门局部盆腔核磁等相关检查，明确瘘管的分支走向以及病变范围大小以后，再进行相关的手术治疗。
高位复杂性肛瘘的手术方式主要采用高位复杂性肛瘘切开挂线手术，如果局部的瘘口增多或者瘘管分支复杂的话，还需要在手术过程当中对局部的病灶进行探查，必要时进行开窗引流等治疗。同时为了加速伤口愈合，手术之后患者一定要坚持换药，避免伤口出现假性感染。
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