乙肝患者可以用到的药物首先是抗乙肝病毒的药物，口服抗病毒药物最开始上市的有拉米夫定、替比夫定、阿德福韦酯等，但目前这三种药物在临床上并不作为首选，因为导致耐药出现的可能性要高一些。目前临床上首选的恩替卡韦或者替诺福韦，新上市的丙酚替诺福韦也可以选择，出现耐药的可能性基本见不到。
如果乙肝病毒导致了肝细胞的损害，需要应用到保肝降酶的药物，比较常用的有还原型谷胱甘肽、硫普罗宁、甘草酸二铵、复方甘草酸苷、异甘草酸镁、多烯磷脂酰胆碱、水飞蓟宾等。保肝降酶的药物有一些是口服的，有一些是静脉应用的，需要根据肝损害的程度进行选择。
如果出现胆红素明显升高，出现黄疸性肝炎，这时还可能应用到退黄的药物，比如熊去氧胆酸胶囊或者丁二磺酸腺苷蛋氨酸注射液。
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