器质性疾病是指由各种原因引起的发生在身体某一器官或某一组织系统中，导致器官或组织系统永久性损伤的疾病。
这被称为“有机”疾病。
器质性疾病的特征是肉眼或显微镜下看到的器官和组织结构的病理变化。受影响器官的功能受损或丧失；疾病严重，病程延长，不易治愈。病变逐渐扩大，严重的病例可能导致死亡。
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