小宝宝腹泻主要口服的药物是蒙脱石散，同时可以配合益生菌治疗，如双歧杆菌，酪酸梭菌和布拉格酵母菌等菌种进行治疗。
如果是由于大肠杆菌、痢疾杆菌等细菌感染引起的腹泻，则需要加用抗生素消炎治疗，如果不过敏可以选择头孢类或者是青霉素类药物，还可以选用黄连素或者庆大霉素等进行治疗。另有研究表明，补充锌制剂可以促进恢复，因此可以口服甘草锌、葡萄糖酸锌等锌制剂。
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