BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途什么？

BLAST套件的blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx子工具的用途分别如下：

1、blastn是将给定的核酸序列与核酸数据库中的序列进行比较。

2、blastp是使用蛋白质序列与蛋白质数据库中的序列进行比较，可以寻找较远亩判的关系。

3、blastx则是将给定的核酸序列按照六种阅读框架将其翻译成蛋白质与蛋白质数据库中的序列进行比对，对分析新序列和EST很有用。

4、tblastn将给定的氨基酸序列与核酸数据库中的序列（双链）按不同的阅读框进行比对，对于寻找数据库中序列没有标注的新编码区很有用。

5、tblastx只在特殊情况下使用，它将DNA被检索的序列和核算序列数据库中的序列按不同的阅读框全部翻译成蛋白质序列，然后进行蛋白质序列比对。

扩展资料

blast的主要特点就是：速度渗耐返快，共线性输出结果简单易读。对于比较小的序列（如 cDNA 等）对大基因组的比对，blast无疑是首选。

blast虽然性能优异，但是它自身也存在着一定的局限性，对于特殊的任务需要注意选择合适的软件。例如blast用于远亲缘物种间的核酸序列比对时，比对精度就不够高，建议使用专门为此用途开发的Blastz软件。

参考资料来源：丛饥百度百科-blat

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