本科各专业学生在入学一年后，按学校相关要求提出转专业申请，目前各专业转出人数比例为1%。学校根据授予学位类别将专业分为授予医学学士学位专业（Ⅰ类专业）和授予非医学学士学位专业（Ⅱ类专业）两类。
Ⅰ类专业：临床医学、麻醉学、医学影像学、儿科学、口腔医学、预防医学、法医学等7个专业。
Ⅱ类专业：生物技术、生物信息学、临床药学、生物医学工程、药学、护理学、法学、公共事业管理等8个专业。
转专业只能在Ⅰ类专业之间、Ⅱ类专业之间互转，Ⅰ类专业和Ⅱ类专业之间不能转；四、五年制的各专业学生不能转入基础医学（“5+2”本硕连续培养）专业，基础医学（“5+2”本硕连续培养）专业学生可以转入Ⅱ类专业。
注：临床医学（“5+3”一体化）、临床医学（“5+3”一体化，儿科学硕士）专业未纳入转专业范围。
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