复旦大学附属中山医院肝脏病医学中心（中山医院肝癌研究所）由复旦大学附属中山医院肝肿瘤内科、肝肿瘤外科组成，组建于1968年。
前身是1968年设立的上海第一医学院中山医院肿瘤小组，1969年正式成立中山医院肝肿瘤小组，并设病房。
1978年改名为中山医院肝癌研究室，开始分为病房和实验室两个部分。其后不断发展壮大，1988年改名为中山医院肝癌研究所，隶属上海医科大学。2000年校合并后，改名为上海医科大学肝癌研究所。
复旦大学附属中山医院肝脏病医学中心是我国最主要的两个肝癌防治研究中心之一，为国家级重点学科（肿瘤学）、上海市肝肿瘤临床医学中心、上海市医学领先专业（肝脏肿瘤学）以及上海医科大学“211工程”建设项目重点学科（肿瘤学）、上海医科大学“985工程”重中之重学科。
临床特色是肝癌早期诊断和早期治疗、不能切除肝癌的缩小后切除。近年又相继开展了肝癌术后复发的手术再切除、冷冻、微波、超声介入、以及生物治疗等特色项目。
自1995年开始以肝癌术后复发转移的防治研究为重点的临床综合治疗研究，探索肝癌术后复发的综合防治方案，进一步延长肝癌病人的生存期，改善预后。
已积累近4000例肝癌诊疗经验，最早开展小肝癌诊治、复发后再切除和不能切除肝癌的缩小后切除，5年生存率达60－70%，迄今所治肝癌病人生存超过5年有368例，生存10年以上有112例，生存最长已达38年1例，居国际领先水平。
复旦大学附属中山医院肝脏病医学中心先后承担“六五”至“九五”的国家科技攻关、美国中华医学基金以及卫生部重点学科基金等重大课题的研究。
先后获国家科技进步一等和三等奖、上海市科技进步一等奖、多项卫生部科技进步奖，以及美国癌症研究所金牌等。
现承担国家重点基础研究发展规划（973）恶性肿瘤项目中的1个子课题、国家“十五”科技攻关、上海市医学领先专业重大项目、上海市医学发展基金重点项目的子课题各两项，以及国家自然科学基金、卫生部基金等项目，并参与“863高科技计划”等重大项目的研究。
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