新冠病毒的核酸检测采用RT-PCR或(和)NGS的方法，在鼻拭子、咽拭子、痰、其他下呼吸道分泌物、血液、粪便、尿液等标本当中，检测新型冠状病毒核酸，检测下呼吸道标本更加准确。
核酸检测的阳性率会受病程、标本采集、检测过程、检测试剂等因素影响，所以为了提高检测阳性率，应规范采集标本，标本采集后要尽快送检。
在临床上，一般具有流行病学史的患者一定要进行核酸检测，通常发病前14天内在有病例报告社区的旅行史或居住史，发病前14天内与新型冠状病毒感染的患者或无症状感染者有接触史，发病前14天内曾接触过来自病例报告社区的发热或者是有呼吸道症状的患者，聚集性发病出现两例及以上发热、呼吸道症状的病例。
如果有流行病学史，并且核酸检测阳性，就可为确诊病例。
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