通过新架设的侦探事务所网页得到了一份乍看之下很简单的委托，当小五郎带着柯南、小兰和安室前往更改的见面场所后依然没有见到委托人，再次回到事务所的他们又收到了委托人的讯息；
佯装离开事务所的他们发觉了其中的蹊跷，再次回到事务所的他们准备揭穿嫌犯的手法，但在这时他们却听到了厕所里传来的枪声...
主要围绕一个银行抢劫案展开的故事。
剧情简介：戴着神秘列车戒指的灰原在事件中被迫服药暂时恢复身体，视频还被发到了网上。组织果然登上了列车，计划杀死雪莉。柯南因此请来有希子和冲矢昴一同登上列车保护灰原，并拜托怪盗基德化装成志保瞒过了组织，并且搞清了小五郎的新弟子安室透就是组织的“波本”。
神秘列车事件过后，柯南一度以为安室不会再出现，然而安室之后竟然仍留在小五郎身边，令柯南不安。柯南不断怀疑身边的安室，后来通过推理怀疑安室是日本公安卧底，大胆...
在神秘委托者的招待下，小五郎与柯南一行人来到了横滨。一行人受邀来到一座巨大城堡，没想到却掉入黑影的神秘男子所设下的陷阱。小兰、毛利小五郎、灰原哀与少年侦探团，带上了携带炸弹的ID，进入游乐园也因此落入敌人手中成为人质。时间限制为12个小时，如果不在时间内解开男子所出的谜题，小兰他们身上的炸弹就会爆炸。
侦探们的镇魂歌
“你能了解失去心爱的人，是什么样的心情吗？工藤。”神秘男子的电脑屏幕上显示着新一与兰的照片。
这名男子居然知道柯南其实就是工藤...
……主要讲的就是围绕一个银行抢劫案展开的故事……
那个女子（抱歉名字什么的不认识）想找出三个抢劫犯吧大概……（抱歉没看完漫画！）
然后把柯南拐走之后引发了N方混战反正就是这么乱啦vermouth啦波本啦冲矢啦还有世良等等相当主线的人物一口气全搀和进来了反正到最后脑子还是乱的（信息量略大），好吧知道这个不能作为最后答案但是亲爱的楼主乃就这么凑合看吧……
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