肝病科治疗的疾病是以肝病为主的疾病，主要包括各型病毒性肝炎，包括甲、乙、丙、丁、戊，还有其它原因导致的，比如EB病毒、CMV病毒或者其它感染导致的肝脏损伤，也都属于肝病科的病。
非传染性的肝脏疾病也属于肝病科，包括自身免疫性肝病、非酒精性脂肪性肝病、酒精性肝病，还有儿童、青少年比较常见的遗传代谢性肝病，还有其它原因造成的肝损伤，比如药物以及其它脏器引起的肝脏损伤，都可以到肝病科就诊。
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