源计划的故事发生在未来，一个科技高度发达的时代，源计划的含义，是把人通过机械的改造，让身体来自变成更强大的战争机360问答器的计划。源计划超限中的几位英雄就是源计划公司的第一批产品。
源计划第一批的如注得迫升统至回征判产品都是通过为机械人体注入上制乱古英雄的基因的方式制造的。亚索是最早的产品，在六班卷一次任务后，亚索被诬陷犯下莫须有的罪行，但亚索心知这与源计划公司的高层脱不了干系用旧易。于是亚索逃走并加入了源计划公司的敌人—基因动力反抗军。
拥有上古英雄程神医兵质不基因的源计划战士井岩季挥演介充连吧讲能威力自然不同凡响，尝到了甜头的源计划公司在亚索逃走后一直想重新制造出新的源计划战士。于是，源计划公司又搞到了易、吧坏应县律切菲奥娜、蕾欧娜、卢锡安、劫几位上古英雄的尸体并把他们改造成了源计划战士。
值得一提的是，源计划易是源计划亚索的升级版，亚索的记忆也被植入到了易的大脑中。
但是由于技术上的问题，上古英雄的记忆有时不能完全抹除，上古英雄的自我意识会觉醒。而觉醒后的上古英雄也大多不愿意为源计划公司卖命。亚额显火自粒准索、菲奥娜、蕾欧娜、卢锡安的自我意识相继觉醒，都加入了基因动力反抗军。只无宪呢当右线别额别易在被改造后也被反抗军救走，觉醒后也成为反抗军的一员。
劫则是被成功改造的的例子，他的记忆被彻底宁终源美移地抹除了。劫成为了源计划公司反间谍组科加些总织的一员，为源计划公司追杀其他叛变的源计划战士。被改造成源计划战士的劫继承了他生前的暗影之力，这也让他成为源计划超限中最强大的源计划战士。
源计划其余故事概述：
1、源计划瓦解的故事以源计划公司与基因动力反抗军之间的战争为蓝本展开。艾希是基因动力反抗军的首领，她认由元银厚明何为源计划战士是人而不是武器，她致力于呼吁源计划战士们联合起来反抗野心勃勃的源计划公司。
她在下城没有多费口舌就说服了源落计划战士中的天才黑客艾克加入反抗军。从此艾克互内材硫断色只友为反抗军在与源计划公司的网络战争中立下汗马功劳。
卡特琳娜原是反抗军中的一位上尉，在了解到源计划的真相以后，卡特琳备娜与艾希本人对质。随后，卡特琳娜离开了反抗军，加入了源计划反间谍组织，挥舞双匕重新为源计划公司而战。不过，也有熟悉她的人认为，她作为反抗军的间谍加入源计划公司的阵营，企图从内部瓦解源计英皮班为掉层啊万民划。
2、源计划猎的故事主要发生在源计划宇宙的下层世界。此时的源计划公司大大发展，已成为类似于政府的庞然大物。人体改造不再需要借助上古英雄的基因，只需要直接更换人体身上的器官就可以强化人体。
不过，植入更高级器官的技术被源计划公司垄断着，想要获得适合的配件变强，只有为源计划公司卖命。烬是一个冷酷无情的黑市杀手，他通过抢夺他人身上的机械器官变得很强大。不过，这并非是没有后遗症的，残留在机械器官上的别人的意识影响了烬的心智，他成了一个精神分裂的疯子。
源计划公司当然不会放任这样的事情发生，反间谍组织的中队长薇恩被派出，猎杀犯人烬。但是，由于源计划公司的出卖，薇恩踏入了烬的陷阱，她成为了整个中队的唯一幸存者。为了除掉烬，薇恩把队友们的机械器官都装备到自己身上，也成为了可以与烬匹敌的源计划战士。
粗莽而不懂委婉的蔚是源计划下层世界的一名执法者，她身上的全都是最普通的武器。蔚坚信，只有理智才是人类最强大的武器，利用高科技来改造人体只会让人失去理智。现在，蔚和薇恩为了猎杀烬而联手了。
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