很多人以为小球藻就是螺旋藻，错！小球藻不是螺旋藻。下面就详细介绍两者的区别：
小球藻的生物分类：绿藻门、绿藻纲、绿球藻目、小球藻科、小球藻属
螺旋藻生物分类：细菌界、蓝菌门、蓝藻纲、颤藻目、颤藻科、螺旋藻属
小球藻生长在淡水中（螺旋藻生长在咸水中），从生物进化论中可知，生命是从咸水中产生，淡水中进化，陆地上生长，淡水比咸水更安全。小球藻，男女老少都可食用。淡水培养小球藻过程中，需循环搅拌，生产成本高，而螺旋藻无需搅拌。
小球藻是单细胞植物，真核生物，有细胞核（螺旋藻是多细胞菌类，原核生物，无细胞核，是简单的有机体）。属于单细胞的生物有：人类、动物、植物和一些藻类如小球藻，小球藻细胞与人类细胞有相近的遗传相关性。
小球藻细胞的体积小（螺旋藻细胞体积大，比小球藻细胞大百倍，肉眼也能看到），需在600倍显微镜下才看得到。小球藻细胞大小与人类红血球相似，只是中心离子结构不同，小球藻细胞中心是镁离子，人类红血球中心是铁离子。
小球藻细胞有3层细胞壁（螺旋藻没有细胞壁，因此无需破壁），而且非常坚硬，由高纤维组成。
小球藻独特的物质-小球藻生长因子CGF（螺旋藻没有这种特殊物质），只有小球藻才拥有这种珍贵独特的成分，世界上尚未发现其他生物含有与CGF生物性质相当的萃取物。CGF含有丰富的核蛋白、核糖核酸RNA、脱氧核糖核酸DNA、多种维生素、氨基酸、多醣类成分、复杂的蛋白质体、酵素、多种植物荷尔蒙等。
小球藻生长因子CGF是具有生物反应修饰作用的活性物质，其生理功能表现为：对于抵抗衰老、活化人体细胞具有重要作用；改善心、肺的带氧功能；激活淋巴细胞，增强巨噬细胞吞噬功能的作用；识别并抑制变异细胞的生长，预防癌症的发生；增强机体的免疫功能；高浓度的叶绿素协同作用，能与体内器官组织中蓄积的重金属、化学有害物质等毒素结合，并将其排出体外；净化体内环境，恢复肝、脾、肾等脏器的解毒功能；平复血压、血脂、血糖值，辅助治疗糖尿病及心脑血管等慢性疾病；促进人体受损伤组织的修复及伤口愈合；改善胃肠功能，防治胃溃疡，促使人体肠道中双歧杆菌和乳酸菌繁殖，具有调节肠道内菌群、灭活致病菌的作用。
小球藻是核酸含量最高的植物。
小球藻是碱性最高的植物（它的碱性生成量是螺旋藻的3倍）。
小球藻是自然界叶绿素最高的植物（是螺旋藻的5倍）。
小球藻中含有天然的生物素（螺旋藻未检出）。
小球藻不含碘（螺旋藻含碘）。
《小球藻和螺旋藻的营养成分及其降血糖活性比较》论文中指出，结果发现，实验中采样的蛋白核小球藻含有比螺旋藻更低的嘌呤核苷酸含量，更高的钙、锌、叶绿素、叶酸和生物素含量，并可以有效降低高血糖小鼠的空腹血糖，具有降血糖功效。
在嘌呤类成分比例上，小球藻的嘌呤核酸总量（142㎎/100g占螺旋藻嘌呤核酸总量的64%），尤其是次黄嘌呤（6.1㎎/100g约占螺旋藻12%）和腺嘌呤（121㎎/100g不到螺旋藻的80%），小球藻显著低于螺旋藻，因而更加符合现代人群的营养补充需求。
对蛋白核小球藻和螺旋藻中钙含量的检测发现，蛋白核小球藻的钙含量（196㎎/100g）是螺旋藻（79.7㎎/100g）的2.5倍，因而作为钙元素天然补充剂更加有效。
蛋白核小球藻的锌含量（407㎎/kg）是螺旋藻（11㎎/kg）的近40倍。可见，对于大脑发育、血压、免疫力和抗辐射健康方面，小球藻比螺旋藻具备更强的优势。
蛋白核小球藻和螺旋藻中叶绿素含量检测发现，蛋白核小球藻（2.30g/100g）是螺旋藻（1.42g/100g）的近2倍，从该角度而言，小球藻是更好的叶绿素补充营养物质，对生血、排毒等更有助益。
通过对蛋白核小球藻和螺旋藻的检测，发现蛋白核小球藻中生物素含量（41ug/100g）是螺旋藻（4ug/100g）的10倍；叶酸含量小球藻（1.7㎎/100g）是螺旋藻（0.11㎎/100g）的16倍，蛋白核小球藻是更加优于螺旋藻的叶酸、生物素补充剂。
研究者认为螺旋藻降低血糖的主要作用方式是通过促进肝糖原合成或抑制其分解来实现的。研究者认同小球藻是通过提高胰岛素敏感性的方式来降低血糖的。因而，在辅助降低高血糖人群的血糖作用方面，两藻存在很强的互补特性。
小球藻细胞微小，无法用简单的过滤法回收，离心成本也很高，且小球藻的细胞壁厚，需要通过破壁技术才能提高消化吸收率，因此生产成本高。而螺旋藻的细胞壁只是一层薄薄的膜，无需破壁，螺旋藻的培养成本价格也相对低很多。
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