乙类传染病有26种，包括了非典，艾滋病，病毒性肝炎，脊髓灰质炎，禽流感，麻疹，流行性出血热，狂犬病，流行性乙型脑炎，登革热，炭疽，细菌性和阿米巴痢疾，肺结核，伤寒和副伤寒，流行性脑脊髓膜炎，百日咳，白喉，新生儿破伤风，猩红热，布氏杆菌病，淋病，梅毒，钩端螺旋体病，血吸虫病，疟疾，人感染链球菌病。
其中非典，肺炭疽，禽流感和脊髓灰质炎虽然属于乙类传染病，但是必须采取甲类传染病的报告和控制措施，也就是在发现之后，城镇要求两小时内进行上报，农村不超过六个小时。乙类传染病要求发现之后，城市六小时上报，农村不超过12小时。
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