《源代码》讲述了一个因执行任务而殉职但还未脑死亡的美国空军飞行员柯尔特史蒂文斯上尉通过由死于列车爆炸的历史教师肖恩芬特雷斯死前八分钟的记忆所制成的源代码，回到列车爆炸前八分钟，寻找将炸弹置于列车的嫌犯的线索，通过一次次的尝试，最终找到嫌犯德瑞克弗罗斯特，并阻止了一场更大的爆炸。
然而一次次的回到源代码，柯尔特发现这几次都有相同之处却又有不同，并且在影片的最后拆除列车上的炸弹的柯尔特在八分钟过后并没有消失，而是在源代码中活了下来。之前在源代码中柯尔特都是死了，所以没有发现在八分钟后，他能在源代码中活下去。当他发现自己在源代码中活下来，并给女军官古德温发了个短信，告诉她源代码比他们知道的功能还要强大，那就是每一段源代码都会衍生出一个平行世界。需要注意的是，他发给古德温的短信不是发给现实世界的古德温，而是发给他所在的那个平行世界的古德温，因为他只能发给跟他同一个世界的古德温，所以他不是改变了现实世界，而是他改变了这个平行世界。
影片一开头就以斯蒂文斯在火车上突然惊醒的茫然为引子，拉开了一个悬念迭起的故事讲述：斯蒂文斯变成了另一个名叫肖恩的历史学教授，克里斯汀娜是肖恩教授的女朋友，斯蒂文斯不明白在自己身上究竟发生了什么？他不认识现在的自己，也不认识克里斯汀娜和火车上的所有人。疾驰的火车上装有一枚恐怖分子的炸弹，爆炸发生在这列火车上，火车上无一人生还。斯蒂文斯在爆炸后回到了一个密闭仓库中，在这个仓库中他渐渐了解到自己其实已经死了，但拉特里奇博士用发明的“源代码”装置留住了斯蒂文斯的未被毁灭的脑电波，再用脑电波的方式实现与其对话。源代码最吸引人的地方，或许就在于环环相扣的紧凑情节，以及对人性毫无遮掩的思索和步步紧逼的扣问，一个不善交流的儿子与年迈父亲的感情，军人的信仰与忠诚以及不断对于我是谁，谁创造了我，谁决定了我的追问。
哲学上来说，人所能拥有的全部自由是选择的自由，也就是所谓的自由意志。从这一方面来讲，斯蒂文上尉至少拥有了选择死亡的自由，即便这个选择给他带来了如此不同的结局。
斯蒂文最终活在了这个由他改变了结局的列车和世界，片中斯蒂文多次地回到爆炸前的八分钟，给列车上的人，以及这个女人带来了不一样的未来和结局，创造源代码的博士说所有的这一切都是虚幻，而最后上尉却真的生活于那个本应是虚幻的世界，这是否说明，对于那些我们否认的梦境和幻想，他们曾经真实地存在
8分钟，时间短暂。每一次的醒来等待着自己的都是克里斯蒂安那温暖而迷人的笑容，等待着主人公对自己问题的回答。一次次的穿梭于“现实”与“幻境”之间，而每次在火车上来醒来都将开始的是一段显得不是那么紧张，有一点的暖心，有一点舍不得中断的对话。自己已经死亡及被利用与科学实验的现实太残酷了，但克里斯蒂安的笑容使得这糟糕的一切变得似乎不那么重要。这部电影涉及的很多理论诸如记忆源代码、平行空间等，很难，不容易完全弄懂。就说说我看懂的吧。人类与生俱来充满着美好的向往，当面对着各般困境时也是如此，紧张而又刺激的镜头过后面对的总是克里斯蒂安一次次暖心的微笑，暖心，踏实，好美。
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